Als ein aus Hamburg kommendes Flugzeug auf dem Logan Airport in Boston landet, findet man nur noch Tote an Bord. Deswegen wird FBI Special Agent Olivia Dunham beauftragt, die Ermittlungen aufzunehmen – sie gehört zu einem gemeinsamen SOKO der verschiedenen Polizei-Institutionen.
Dann wird ihr Partner, Special Agent John Scott, im Zuge der Ermittlungen fast getötet. Olivia sucht verzweifelt nach jemandem, der sie unterstützen kann, und stößt auf Dr. Walter Bishop, den Einstein unserer Generation.
Aber die Sache hat einen Haken: Er lebt seit 17 Jahren in einem Sanatorium – um ihn befragen zu können, muss sein Sohn Peter seine Einwilligung geben – doch der will nichts mehr mit seinem Vater zu tun haben.
Olivias Ermittlungen führen zum milliardenschweren Konzern Massive Dynamic und der intriganten Firmenmanagerin Nina Sharp. Unser Trio wider Willen arbeitet jetzt mit Agent Phillip Broyles vom Verfassungsschutz sowie den FBI-Agenten Charlie Francis und Astrid Farnsworth zusammen und entdeckt, dass die Affäre um den tödlichen Flug immer größere Kreise zieht – die Dimensionen sind schockierend.

Anna Torv (Agent Olivia Dunham) ● Joshua Jackson (Peter Bishop) ● Lance Reddick (Agent Phillip Broyles) ● Blair Brown (Nina Sharp) ● Jasika Nicole (Astrid Farnsworth) ● John Noble (Dr. Walter Bishop) ● Kirk Acevedo (Agent Charlie Francis) ● Michael Cerveris (The Observer) ● Mark Valley (John Scott)